使用 conda env 部署 Django

沒幾天前剛部署一次 Django,記錄在《使用 uWSGI、nginx、systemd 部署 Django》。今天又部署了另一個專案。部署的設定跟上次一樣:

nginx -- unix socket -- uWSGI -- Django

一樣寫一個 PROJ.service 的 systemd unit 來管理網站的啟動 (uWSGI ...

Ensembl Genomic Reference in Bioconductor

Using fundamental R/Biocondcutor packages (e.g. AnnotationHub, ensembldb and biomaRt) to query Ensembl genomic references or annotations.

使用 uWSGI、nginx、systemd 部署 Django

上一次很認真的 Django 部署記錄在《設定 Python 官方文件中文化自動更新 Server》一文。很巧地自己畢業的題目也要架個 Django 網站,所以就再跑了一次部署設定。舊文還提了有的沒的,這篇僅針對 Django 的部署。

這邊的部署設定都儘量不使用 root 權限,整個連線的流程圖如下:

nginx -- unix socket -- uWSGI ...

Jupyter Notebook Progress Bar

相信很多人都已經在使用 Jupyter (IPython) Notebook 跑分析。隨著分析的資料越跑越多,有時候刷下去就是幾十分鐘甚至數小時。此時沒有個進度條還蠻無聊的,而且能讓自己感覺很有進度,何樂不為呢?

例如我去年介紹 aiohttp 時就有用到 notebook 和 console 底下的進度條 (progress bar)。不過,這幾個月 Jupyter ...

Python 官方文件中文化 Server HTTPS 使用 Let's Encrypt

整理了 server 從 HTTP 到 HTTPS 相關設定的調整。

Add code block language name into CSS classes in Pelican Markdown

I used Pelican and its Markdown plugin to render blog post.

Recently I was playing with the Python Official Documentation, which has a decent ...

設定 Python 官方文件中文化自動更新 Server

設定一個自動更新 Python 說明文件中文翻譯並且 host 中文化網頁版文件的 server。使用 Django 作 web server、Django-Q 做為 task queue,deploy stack 用 nginx、uWSGI,host 於 Amazon EC2 (Debian Jessie),資料庫用 PostgreSQL,並用 systemd 管理相關的 process。

安裝 PostgreSQL 9 於 Debian Jessie / OSX

平常用最多的是 SQLite,但 PostgreSQL 有很多好用的功能,每次要用想不起來怎麼裝。總之把相關設定的筆記存在這。

Debian Jessie (Debian 8.3) 與 OSX Homebrew 舉例。不過 OSX 大概也不會沒事把 PostgreSQL 開著,主要是著重在 Debian ...

Coding 初學指南附錄 - Bioinfo Practices using Python

A walk through of practices created by Rosalind Team.

Coding 初學指南附錄 - OSX 開發環境

我自己在 OSX 上的主觀開發環境設定