使用 conda env 部署 Django

沒幾天前剛部署一次 Django,記錄在《使用 uWSGI、nginx、systemd 部署 Django》。今天又部署了另一個專案。部署的設定跟上次一樣:

nginx -- unix socket -- uWSGI -- Django

一樣寫 …

Ensembl Genomic Reference in Bioconductor

Using fundamental R/Biocondcutor packages (e.g. AnnotationHub, ensembldb and biomaRt) to query Ensembl genomic references or annotations.

使用 uWSGI、nginx、systemd 部署 Django

上一次很認真的 Django 部署記錄在《設定 Python 官方文件中文化自動更新 Server》一文。很巧地自己畢業的題目也要架個 Django 網站,所以就 …

Jupyter Notebook Progress Bar

相信很多人都已經在使用 Jupyter (IPython) Notebook 跑分析。隨著分析的資料越跑越多,有時候刷下去就是幾十分鐘甚至數小時。此時沒有個 …

Python 官方文件中文化 Server HTTPS 使用 Let's Encrypt

整理了 server 從 HTTP 到 HTTPS 相關設定的調整。

Add code block language name into CSS classes in Pelican Markdown

I used Pelican and its Markdown plugin to render blog post.

Recently I was playing with the Python Official Documentation, which has a decent code syntax highlighter powered by Pygments.

What’s more, the output of code examples can be toggled. That is, a code example:

>>> print('Hello World')
Hello …

設定 Python 官方文件中文化自動更新 Server

設定一個自動更新 Python 說明文件中文翻譯並且 host 中文化網頁版文件的 server。使用 Django 作 web server、Django-Q 做為 task queue,deploy stack 用 nginx、uWSGI,host 於 Amazon EC2 (Debian Jessie),資料庫用 PostgreSQL,並用 systemd 管理相關的 process。

安裝 PostgreSQL 9 於 Debian Jessie / OSX

平常用最多的是 SQLite,但 PostgreSQL 有很多好用的功能,每次要用想不起來怎麼裝。總之把相關設定的筆記存在這。

Debian Jessie (Debian 8.3) 與 OSX …

Coding 初學指南附錄 - Bioinfo Practices using Python

A walk through of practices created by Rosalind Team.

Coding 初學指南附錄 - OSX 開發環境

我自己在 OSX 上的主觀開發環境設定